A Mesa Diretora exerce a função administrativa da Câmara Municipal, ou seja, é responsável por sua organização interna, pela regulamentação de seu funcionalismo, pela estruturação e direção dos serviços auxiliares e pela gestão do orçamento da Casa. A Mesa Diretora é constituída pelo presidente, vice-presidente, secretário e tesoureiro. Para a composição da Mesa, excluída a primeira de cada legislatura, é feita uma eleição na última sessão legislativa de cada ano e os parlamentares eleitos passam a dirigir o Poder Legislativo a partir do dia 1º de janeiro. Para mais detalhes sobre a eleição da Mesa Diretora, confira o capítulo IV do Regimento Interno.
Para a sessão legislativa de 2023, a Mesa Diretora da Câmara de Vereadores de São Borja é composta pelos parlamentares:
PRESIDENTE: Elvio Feltrin (PP)
VICE-PRESIDENTE: Jefferson Olea Homrich (PTB)
SECRETÁRIO: Marcelo Robalo (PSB)
TESOUREIRO: Fabrizio Dipamil (PP)
